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Schlagwort: Bioinformatik

#Software in der Bioinformatik (4) — Warum BioinformatikerInnen vor einer Arbeit in nicht-IT Arbeitsgruppen sehr vorsichtig sein sollten

Admin024 mins

„Software in der Bioinformatik (4) — Warum BioinformatikerInnen vor einer Arbeit in nicht-IT Arbeitsgruppen sehr vorsichtig sein sollten“ Zusammen mit Kollegen an anderen Einrichtungen bemerke ich immer wieder, dass nicht-IT-affine Universitätsarbeitsgruppen für bestimmte Projekte eine(n) BioinformatikerIn zu einer Masterarbeit oder Doktorat “anheuern”. Heraus kommt eine Software … Damit das hier ein konstruktiver Beitrag wird, brauchen…

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#Software in der Bioinformatik (3) — Die “beliebtesten Artikel” in BMC-Bioinformatics – rupture de caténaire

Admin024 mins

„Software in der Bioinformatik (3) — Die “beliebtesten Artikel” in BMC-Bioinformatics – rupture de caténaire“ Dieser Tage erreichte mich eine Mail – siehe Bild. So so, also die beliebtesten Artikel in “BMC Bioinformatics“. Nein, die Artikel, welche die meiste online-Aufmerksamkeit erregten. Das ist in der Tat etwas anderes. Was genau? Der Link zur Metric von…

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#Software in der Bioinformatik (2) – p-Hacking war gestern (ein kleines KI-Bashing) – rupture de caténaire

Admin012 mins

„Software in der Bioinformatik (2) – p-Hacking war gestern (ein kleines KI-Bashing) – rupture de caténaire“ Die eiserne Regel in der Statistik (und eigentlich jeglicher experimenteller Wissenschaft): Erst planen, dann erheben, dann auswerten. Alles Andere führt zu einer langen Kette von Problemen, die man Studierenden von Naturwissenschaften seit langer Zeit in Grundpraktika vermittelt. Diese Überlegung…

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#“Corona” – Heutige Beiträge auf der International Supercomputing Conference (ISC) – rupture de caténaire

Admin04 mins

„“Corona” – Heutige Beiträge auf der International Supercomputing Conference (ISC) – rupture de caténaire“ Besondere Zeiten sind dies. De facto findet die “International Supercomputing Conference” (ISC) in diesem Jahr ausschließlich online statt. Es ist DIE Konferenz im High Performace Computing (HPC)-Bereich in der unter anderem im halbjährlichen Wechsel mit ihrem amerikanischen Pendant die Liste der…

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#“Corona” – Die Jagd auf antivirale Wirkstoffe – rupture de caténaire

Admin013 mins

„“Corona” – Die Jagd auf antivirale Wirkstoffe – rupture de caténaire“ Gerade lernen wir, dass Covid-19 wohl auch erhebliche Folgeschäden provozieren kann. Beispielsweise kann das SARS-CoV-2-Virus die Nieren stark schädigen [Puelles et al., 2020], mögliche Lähmungen des Atemsystems verursachen und macht vor der Psyche nicht halt[Rogers et al., 2020]. Vor allem aber kann es auch…

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#Warum man seine Werkzeuge gut wählen sollte (2) – rupture de caténaire

Admin03 mins

„Warum man seine Werkzeuge gut wählen sollte (2) – rupture de caténaire“ Wer könnte meinen “schlechte Werkzeuge (in der Bioinformatik)”-Rant besser fortsetzen als Randall Munroe mit dem aktuellen xkcd-Comic? Nein, keine Angst: Sooo läuft Bioinformatik tatsächlich nicht ab. Das Comic übertreibt vollkommen. Und doch … Anwendung von allgemeinen Programmen, die nie für die Aufgabe gedacht…

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#Mitochondrial Aging, progress on triple-negative breast cancer and the probability of a common ancestor are my MolBio Picks of the Week

Admin010 mins

„Mitochondrial Aging, progress on triple-negative breast cancer and the probability of a common ancestor are my MolBio Picks of the Week“ It’s been a while since the last edition, but this week, the MolBio Picks of the Week (usually at home over at MolBio Research Highlights) are hosted here! If you are interested in one…

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