#Bessere Literaturrecherche mit dem PubPeer Browserplugin – rupture de caténaire

„Bessere Literaturrecherche mit dem PubPeer Browserplugin – rupture de caténaire“ PubPeer ist eine wunderbare Plattform, auf der öffentlich nachgeholt werden kann, was bei PeerReview übersehen wurde! Wann immer ein kleiner Fehler in einer Publikation gefunden wird, gar eine Fälschung oder schlicht Diskussionsbedarf besteht, hier kann hart, aber kollegial Öffentlichkeit hergestellt werden. Klar, es ist ein…

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#F.A.I.R. sollen Eure Daten sein! – Ein grober Überblick über die Herausforderungen wissenschaftlichen Datenmanagements – rupture de caténaire

„F.A.I.R. sollen Eure Daten sein! – Ein grober Überblick über die Herausforderungen wissenschaftlichen Datenmanagements – rupture de caténaire“ Wer von euch hat schon mal wissenschaftlich gearbeitet? Eine Diplom-, Bachelor-, Master- oder gar Doktorarbeit? Dann habt ihr auch Datenmanagement betreiben müssen. Die Wahrscheinlichkeit ist groß und sie steigt mit dem Alter eurer Arbeit auf 100 %,…

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#Schreibt Bugreports! – rupture de caténaire

„Schreibt Bugreports! – rupture de caténaire“ Alle Software – sofern nicht sehr klein oder sehr lange gepflegt (Jargon: “gut abgehangen”) – enthält Fehler. Immer. Wissenschaftliche Software insbesondere, denn sie ist oft komplex, leider zu oft von Leuten entwickelt, die wenig Ahnung von Softwareentwicklung haben (was zusätzliche Fehlerquellen einführt) und nicht zuletzt wird sie häufig als…

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#Bioinformatische online Tools – ein Ärgernis – rupture de caténaire

„Bioinformatische online Tools – ein Ärgernis – rupture de caténaire“ Wissenschaft ohne Internet ist kaum mehr denkbar – egal um welche Disziplin es geht. Dafür wurde es auch (u.a.) erfunden: Literaturdatenbanken, Sequenzdatenbanken, Genomdatenbanken, Ligandendatenbanken, sie alle nur Beispiele aus der Bio- bzw. Cheminformatik und sie sind selbstverständlich über einen Browser zugänglich. Gut gepflegte Datenbanken kennen…

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#Interview mit David Sanders auf Retraction Watch – rupture de caténaire

„Interview mit David Sanders auf Retraction Watch – rupture de caténaire“ Vor ein paar Wochen wurde hier im Blog die Arbeit der Wissenschaftsaktivistin Elisabeth Bik vorgestellt, die in einschlägigen Kreisen (Zell-Biologie / Physiologie) dafür bekannt ist bewusst veränderte und gefälschte experimentelle Befunde finden zu können. Sie teilt sehr häufig ihre Entdeckungen den Journaleditoren und Autoren…

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#Pain with PAINS – rupture de caténaire

„Pain with PAINS – rupture de caténaire“ Die Suche nach neuen Wirkstoffen gegen Krankheiten ist eine langwierige, mühsame und teure Angelegenheit. Innovationen gibt es, aber längst nicht in so schneller Folge wie noch vor einigen Jahrzehnten – jedenfalls wenn die moderne Biotechnologie außer Acht gelassen wird und man den Blick auf Wirkstoffe im Sinne einzelner…

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#Zutaten zur Reproduzierbarkeitskrise (9) – runs-on-my-system Software und schwer installierbare Software – rupture de caténaire

„Zutaten zur Reproduzierbarkeitskrise (9) – runs-on-my-system Software und schwer installierbare Software – rupture de caténaire“ Ihr ahnt nicht, was es so gibt in der schönen Welt des wissenschaftlichen Rechnens. Viele Programmierer werfen ihren Nutzern einfach so ihre Software vor die Füsse und kümmern sich danach einfach nicht mehr darum. Schließlich funktioniert die fragliche Software ja….

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#Nur ein Ärgernis? – Blender in Wissenschaft! – rupture de caténaire

„Nur ein Ärgernis? – Blender in Wissenschaft! – rupture de caténaire“ Es gibt Tage, da frage ich mich, ob ich zu wenig verdiene. Schließlich erledige ich “nebenher” Lehrleistungen, die zumindest bezüglich der mittleren Semesterwochenstundenzahl so manchen Lehrstuhlinhaber in den Schatten stellt. Da es bei mir um IT geht, könnte ich den Vergleich mit manchem kommerziellen…

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#Die COVID19-Pandemie – Schlag gegen evidenzbasierte Medizin und Licht am Ende des Tunnels? – rupture de caténaire

„Die COVID19-Pandemie – Schlag gegen evidenzbasierte Medizin und Licht am Ende des Tunnels? – rupture de caténaire“ In der Ausgabe vom 12. Mai schrieb Helen Pearson einen Artikel in Nature unter dem Titel “How COVID broke the evidence pipeline“. Sie kommt sehr schnell auf den Punkt und zeigt, dass mit Ausbruch der COVID-19-Pandemie viele Studien…

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#Zutaten zur Reproduzierbarkeitskrise (8) – Der Trend zum Jupyter-Notebook – rupture de caténaire

„Zutaten zur Reproduzierbarkeitskrise (8) – Der Trend zum Jupyter-Notebook – rupture de caténaire“ Wie ich schon vor ein paar Tagen schrieb: Ich unterrichte WissenschaftlerInnen aus nicht-IT-affinen Wissenschaften in Programmierung mit C++ und Python (und shell-Programmierung, etc.). Und das macht Spaß, ich hoffe sehr darauf, dass ich im Spätsommer oder Herbst die Kurse wieder in einem…

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